أنشأت وزارة الصحة المصرية المعهد العالي للصحة العامة بالإسكندرية عام 1956 وذلك للتغلب على العجز الملحوظ في تعليم الخريجين وتدريبهم في مجالات الصحة العامة المختلفة.

الهدف الأساسي من إنشاء المعهد هو دعم منظومة الصحة العامة في مصر والدول الأخرى بالمنطقة بأفراد لديهم المعرفة و المهارات اللازمة لتحقيق عملية التنمية في مجال الصحة بفاعلية وكفاءة.
وقد شهد عام 1963 انضمام المعهد لجامعة الإسكندرية كي يصبح أول معهد عالي متخصص في الصحة العامة بمنطقة شرق البحر الأبيض المتوسط.
وقد تلقى المعهد العالي للصحة العامة دائماُ دعماً قوياً من مكتب منظمة الصحة العامة بمنطقة شرق البحر الأبيض المتوسط وبالتالي فقد توطدت العلاقات بين المنظمة والمعهد بشكل ملحوظ في العديد من المجالات التي تشمل التعليم بشهادة وبدون شهادة في المجالات الفنية والاستشارية والبحثية.